LOGICIEL PHENYX

Phenyx est un logiciel développé par Genebio en collaboration avec l'Institut Suisse de Bioinformatique, permettant l'identification et la caractérisation de protéines et peptides provenant de données acquises en spectrométrie de masse (PMF et tandem MS).

Phenyx présente de nombreuses caractéristiques, dont :

• installation facile de banques données génomiques et protéiques afin d’y effectuer des recherches,
• grâce à son algorithme OLAV, Phenyx optimise les scores pour votre spectromètre de masse d'où une meilleure fiabilité et précision dans les résultats d'identification,
• résolution de conflits (quand un spectre match plus d' une séquence de peptides),
• comparaison de résultats, incluant aussi l' option d' importer des résultats d' autres logiciels (Mascot et SEQUEST),
• possibilité de soumettre plus d'une base de données à la fois,
• différentes vues dynamiques sur l'interprétation des peptides (vue par spectre, par fragments d'ions..) et rapports exportables dans différents formats (Excel, XML...)
• les modifications post traductionnelles, les mutations d’acide aminés annotés dans Swiss Prot apparaissent dans l’identification proposée,
• possibilité de soumettre plusieurs spectres de masse simultanément pour identification,
• les principaux types de format de spectre de masse sont reconnus par Phenyx,
• de nombreux critères d’interrogation sont ajustables par l’utilisateur afin d’affiner les recherches,
• console de management pour gérer les profils et paramètres utilisateurs (modification des acides aminés, règle de clivage enzymatique) et générer divers rapports.

Plus d’informations à la page suivante:
http://www.phenyx-ms.com/about/features.html